Dalam menjamin mutu pelayanan, Balai Pengamanan Fasilitas Kesehatan (BPFK) Jakarta memiliki Laboratorium Kalibrasi, Laboratorium Penguji, Laboratorium/Lembaga Inspeksi dan Penyelenggara Uji Profisiensi yang telah terakreditasi oleh Komite Akreditasi Nasional (KAN) diantaranya :

1. Laboratorium Kalibrasi - LK-110-IDN

   
   

2. Laboratorium Penguji - LP-465-IDN

   
   

3. Lembaga Inspeksi Tipe A - LI-076-IDN