Aplikasi SIPATEN (Sistem Informasi Pengamanan Fasilitas Alat Kesehatan) merupakan aplikasi webbase yang dikembangan oleh BPFK Jakarta untuk mempermudah pelanggan, khususnya bagi sarana pelayanan fasilitas kesehatan dan institusi atau lab penguji dalam mengajukan permintaan pelayanan pengujian/kalibrasi alat kesehatan, uji kesesuaian, uji produk, kalibrasi alat ukur, inspeksi sarana & prasarana, pengujian TLD dan uji profisiensi di BPFK Jakarta. Aplikasi SIPATEN dapat diakses melalui url https://sipaten.bpafkjakarta.id Bagi pelanggan lama, customer dapat melakukan login dengan menggunakan email dan password yang sudah diberikan melalui email bersamaan dengan email Surat Penawaran Harga (SPH) yang sudah pernah dikirimkan, sedangkan bagi pelanggan baru dapat melakukan pendaftaran akun terlebih dahulu untuk menggunakan aplikasi SIPATEN. Untuk saat ini pelanggan hanya bisa menggunakan 1 email akun untuk 1 sarpelkes Adapun akses yang didapat pelanggan didalam aplikasi SIPATEN diantaranya :